В России интерес к исследованию и использованию костного мозга возник примерно во второй половине XIX века, когда впервые возникла идея трансплантации костной ткани. В 1895 году публикуется монография И. Роецкого «О костном мозге как органе кроветворения».
В 1927 году советские врачи М. Аринкин и М. Лисицын разрабатывают метод извлечения костного мозга с помощью иглы введенной в губчатую кость. Методика совершенствуется и тогда же начинаются первые экспериментальные попытки трансплантаций: больным, страдающим анемией, вводили взвесь костного мозга внутримышечно и даже внутривенно.
Новый этап в истории изучения костного мозга начинается в конце 1950-х после Второй мировой войны. Ученые и врачи всего мира стали активно искать способы лечения от лучевой болезни, в частности от апластической анемии, которую она вызывает. В 1960-е годы в нескольких институтах гематологии России используют введение костномозговой взвеси от доноров при лечении пациентов с апластической анемией.
Тем временем в мире, в 1958 году, происходит значимое для всей современной трансплантологии событие - Ж. Доссе знаменитый французский иммунолог, открывает HLA-комплекс, поняв, что с отторжением пересаженной ткани связаны именно антигены лейкоцитов. HLA-систему начинают активно изучать в СССР.
В конце 80-х – начале 90-х годов XX века в Москве и Санкт-Петербурге регулярно проводятся трансплантации костного мозга от аллогенных HLA-идентичных доноров при лейкозах и апластической анемии, больным гемобластозами, пострадавшим в аварии на ЧАЭС. В 1985 году Советские учёные проводят успешную трансплантацию костного мозга пациентке с острым лейкозом. После пересадки женщина прожила в периоде ремиссии почти 25 лет.
С начала 90х годов количество медицинских учреждений в России, использующих при лечении больных трансплантацию костного мозга увеличивается. Трансплантации проводят как у взрослых, так и у детей. В 1991 году, профессор Борис Афанасьев провел первую в СССР успешную трансплантацию костного мозга у ребенка. Пациентом стал пятилетний мальчик с острым лимфобластным лейкозом, донором — его брат.
В наши дни трансплантация костного мозга и гемопоэтических стволовых клеток успешно развивается и назначается для лечения злокачественных заболеваний крови, при которых неправильно функционирует костный мозг. С 1 сентября 2022 года в России начал функционировать Федеральный регистр доноров костного мозга и гемопоэтических стволовых клеток (ФРДКМ). Расширение Федерального регистра позволит не только быстрее найти подходящего донора, но и обеспечит многообразие именно российских генотипов, так как наиболее подходящим донором для россиянина может стать именно человек с российскими корнями.